home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00301 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  42 lines
  1. *******************************
  2. * p53 tumor antigen signature *
  3. *******************************
  4.  
  5. The p53 tumor antigen [1 to 5] is a protein  found  in  increased amounts in a
  6. wide variety of transformed cells. It is also detectable in many proliferating
  7. nontransformed cells,  but  it  is  undetectable  or  present at low levels in
  8. resting cells.  It is  frequently  mutated or  inactivated in  many  types  of
  9. cancer.  p53 seems to act as a tumor suppressor in some, but probably not all,
  10. tumor types.  p53 is probably involved in  cell cycle regulation, and may be a
  11. trans-activator   that  acts  to  negatively   regulate  cellular  division by
  12. controlling a set of genes required for this process.
  13.  
  14. p53 is a phosphoprotein of about 390 amino acids which  can be subdivided into
  15. four domains: a highly charged acidic region  of  about 75  to  80 residues, a
  16. hydrophobic proline-rich  domain (position 80 to 150), a  central region (from
  17. 150 to about 300),  and a highly basic C-terminal region.  The sequence of p53
  18. is well conserved in vertebrate species;  attempts  to  identify  p53 in other
  19. eukaryotic philum has so far been unsuccessful.
  20.  
  21. As a signature pattern for p53 we selected a perfectly conserved stretch of 14
  22. residues located in the central region of the protein.   This region, known as
  23. domain IV in [3], is involved (along  with an adjacent region)  in the binding
  24. of the large T antigen of SV40.  In man this region is the focus  of a variety
  25. of point mutations in cancerous tumors.
  26.  
  27. -Consensus pattern: M-C-N-S-S-C-M-G-G-M-N-R-R-P
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: December 1992 / Text revised.
  31.  
  32. [ 1] Levine A.J., Momand J., Finlay C.A.
  33.      Nature 351:453-456(1991).
  34. [ 2] Levine A.J., Momand J.
  35.      Biochim. Biophys. Acta 1032:119-136(1990).
  36. [ 3] Soussi T., Caron De Fromentel C., May P.
  37.      Oncogene 5:945-952(1990).
  38. [ 4] Lane D.P., Benchimol S.
  39.      Genes Dev. 4:1-8(1990).
  40. [ 5] Ulrich S.J., Anderson C.W., Mercer W.E., Appella E.
  41.      J. Biol. Chem. 267:15259-15262(1992).
  42.